Post-Doctorant en Métagénomique des Sols Historiques H/F - Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN)
Les missions du poste
Le poste est au sein de l'UMR ISYEB (Institut de Systématique, Évolution et Biodiversité ; https://isyeb.mnhn.fr/fr) du Département Origines et Évolution, sur le site du Jardin des Plantes. L'ISYEB contribue aux activités de la mission du Muséum en termes de recherche, d'enseignement, d'expertise et de diffusion. Le chercheur recruté intègrera l'équipe INEVEF (Interactions et Evolution Végétale et Fongique).
La personne recrutée est placée sous la direction directe de Roland MARMEISSE, Directeur de Recherches au CNRS.
Le poste s'ouvre dans le cadre scientifique du projet Past2ECO, lauréat de l'appel à projets 2025 du PEPR Agroécologie et Numérique, mobilisant des données génétiques historiques (collections d'herbier) et contemporaines (centres de ressources biologiques) pour mieux comprendre les mécanismes d'adaptation des cultures de blé et de sorgho face au changement climatique : https://www.pepr-agroeconum.fr/les-projets-finances/ressources-genetiques/laureat-aap/past2eco
Missions du poste :
- Traitement bio-informatique des jeux de données de séquences issues de séquençage haut-débit, assemblage, extraction des séquences microbiennes, validation de la "nature ancienne" des séquences issues d'herbiers (principale)
- Annotations (affiliation) taxonomique et fonctionnelle de séquences anciennes et modernes (principale)
- Gestion des données obtenues, soumission à des bases de données (principale)
- Analyse de données quantitatives et statistiques avec le logiciel R (principale)
- Extraction d'acides nucléiques de nouveaux échantillons d'herbier et modernes et leur séquençage
- Présentation des résultats à la communauté scientifique (poster et congrès en anglais) ainsi que dans le cadre de manifestations grand public (principale)
- Valorisation des travaux sous forme de publications scientifiques (principale)
Le profil recherché
Compétences ou connaissances particulières souhaitées :
- Connaissances et pratique de la paléogénomique/paléogénétique
- Compétences en bio-informatique dans un contexte de métagénomique
- Analyse des données quantitatives et statistiques avec R
- Anglais lu et parlé
- Capacité de communication et d'interaction avec les autres membres de l'équipe / laboratoire et partenaires du projet
- Présentation des résultats scientifiques (poster et congrès en anglais), synthèse bibliographique et participation à l'écriture de publications.
Compétences requises
- Statistiques
- Gestion des données
- Anglais
- Analyse de données
- Bio-informatique
- Macromolécule biologique
