Ingénieur·e Chargé·e de Recherche en Protéomique et Signalisation Redox H/F - Ecole supérieure de physique et de chimie industrielles de la Ville de Paris

L'ingénieur/e sera rattaché/e au laboratoire de Spectrométrie de Masse Biologique et Protéomique
de l'ESPCI Paris (SMBP, dirigé par Joelle Vinh), sous la supervision de Giovanni Chiappetta

Présentation du projet :
Le projet ERXCUE, financé par l'ANR, vise à étudier comment les cellules s'adaptent - ou
échouent à s'adapter - au stress du réticulum endoplasmique (ER), en se concentrant sur le
remaniement du métabolisme thiol-redox. L'objectif est d'identifier les processus redox qui
influencent la décision cellulaire entre la survie et l'apoptose lors de la réponse aux protéines non
repliées (UPR). En combinant des approches -omiques non biaisées et des études ciblées au niveau
protéomique subcellulaire, l'ingénieur/e sera explorera comment les activités redox participent à la
régulation de l'UPR et au destin cellulaire.

Missions & responsabilités :
- Analyse Protéomique et Redoxomique :
o Concevoir et réaliser des expériences de spectrométrie de masse (LC-MS/MS) pour
identifier et quantifier les modifications redox et post-traductionnelles dans les
protéines impliquées dans l'UPR.
o Se concentrer sur les modifications des thiols et les protéines redox-actives.
- Intégration des Données :
o Intégrer les données de protéomique redox avec les données de transcriptomique
pour créer une cartographie complète des voies redox régulées par l'UPR.
o Utiliser des outils de bioinformatique pour corréler les données protéomiques avec
les états redox cellulaires et les transitions UPR.

- Conception Expérimentale :
o Développer et optimiser des méthodes de fractionnement subcellulaire et de redoxomique ciblant des organites spécifiques, en particulier le réticulum endoplasmique (ER).

o Mettre en oeuvre des workflows innovants pour cartographier les modifications
redox spécifiques à l'ER et l'activité redox sous conditions de stress UPR.

- Recherche Collaborative :
o Travailler en étroite collaboration avec les équipes de biologie redox et de métabolomique pour comprendre comment les changements dans le métabolisme
thiol-redox et d'autres voies affectent les réponses cellulaires au stress de l'ER.

o Étudier le remaniement métabolique sous UPR et son impact sur le protéome.

Connaissances et qualités recherchées :
- Principes et expériences en analyse protéomique,
- Traitement des données quantitatives de protéomique,
- Culture cellulaire humaine
- Connaissance du langage R
Diplome : PhD en biochimie, chimie analytique, biologie
Expérience souhaitée : 3ans

• Gestion des données
• Spectrométrie de masse
• Bio-informatique