Ingénieur d'Etude en Bioinformatique H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Intégrée à une équipe de recherche, la personne recrutée aura pour mission principale de déterminer les perturbations post-transcriptionnelles induites par des mutations dans l'hélicase DDX6 dans les cellules humaines. Elle analysera des jeux de données RNAseq obtenus à partir d'ARN total et polysomal pour identifier les transcrits dérégulés au niveau stabilité et/ou traduction, déterminer les caractéristiques de ces ARN, et proposer les voies de régulation perturbées. L'Activité - Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq - Analyse différentielle et fonctionnelle - Développement et optimisation de pipelines- Comparaison avec des jeux de données publiés- Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l'équipe Votre Profil Compétences - Maîtrise des outils RNAseq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation- Maîtrise des outils d'analyse des isoformes d'ARN- Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères- Expérience en analyse des isoformes dans des modèles mammifères- Rigueur, autonomie, dynamisme, esprit d'initiative.- Rédaction de rapports clairs, présentation des résultats à des non-bioinformaticiens Votre Environnement de Travail La personne recrutée exercera son activité dans l'équipe « mRNP et condensats » dirigée par Dominique Weil, au Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (UMR8263, unité mixte CNRS-Inserm-Sorbonne Université) à l'Institut de Biologie Paris Seine (IBPS). Ce laboratoire est situé sur le campus Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université. Le poste est financé par l'ANR dans le cadre d'un projet visant à comprendre le rôle de l'hélicase DDX6 et de condensats d'ARN et protéines (P-bodies) dans le neurodéveloppement. Des mutations de cette hélicase sont responsables d'une maladie neurodéveloppementale associée à un déficit de P-bodies. L'équipe travaille sur des modèles de cellules humaines dans lesquelles les mutations des patients ont été introduites. Composée de biologistes, elle comprend quatre chercheuses et enseignants-chercheurs, une ingénieure d'étude, un post-doctorant et une doctorante. La personne recrutée travaillera en collaboration étroite avec le post-doctorant et les chercheurs associés à cet axe de recherche. Rémunération et avantages Rémunération entre 2 467 € et 3786 € brut mensuel selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR8263-DOMWEI-003 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) Expérience souhaitée 1 à 4 années À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

• Dynamisme
• Autonomie
• Pro-activité
• Contrôle qualité