Chargé de l'Ingénierie et de la Qualité des Données du Pôle Collections Naturalistes pour le Programme Dynabiod H/F - Muséum National d'Histoire Naturelle

Contexte du recrutement et définition de poste

Contexte :

La direction générale déléguée aux collections (DGD-C) contribue aux activités de la mission du Muséum national en termes de recherche, d'enseignement, d'expertise et de diffusion. Elle acquiert, collecte, conserve, signale, communique et valorise, sur place et à distance, l'ensemble des collections naturalistes et documentaires de l'établissement.

Au sein de la DGD-C, la délégation à la coopération, à l'informatisation et à la numérisation des collections (DCIN) est chargée de coordonner et piloter la participation scientifique, technique et institutionnelle de l'établissement aux infrastructures de recherche nationales et internationales dont l'établissement est partie prenante, et de la doter d'une structure d'appui, d'expertise, de coordination et de pilotage transverse dans le secteur en fort développement des données et du numérique en lien avec les collections naturalistes. Les activités de la délégation se concentrent sur les données descriptives, taxinomiques et de gestion ainsi que sur la numérisation des données 2D ou 3D des collections naturalistes.

La DCIN assure le pilotage et la participation à des programmes scientifiques menés en partenariat avec d'autres établissements scientifiques. Le PEPR Dynabiod s'inscrit pleinement dans cette dynamique. Son ambition est de comprendre comment la biodiversité a évolué au cours des derniers siècles afin de mieux éclairer les défis environnementaux actuels et futurs. Pour y parvenir, les collections d'histoire naturelle constituent une ressource scientifique exceptionnelle. Dans ce cadre, la personne en charge de la qualité et des flux de données s'appuiera non seulement sur les collections du Muséum, mais également sur celles des 90 établissements membres du réseau national Récolnat. La mobilisation et la mise en qualité de ces millions de données, rassemblées et accessibles grâce aux infrastructures numériques du réseau, permettront aux chercheurs de modéliser les trajectoires de la biodiversité à l'échelle du territoire français, des plaines aux massifs montagneux, et d'analyser les effets des changements climatiques, des transformations des paysages et des activités humaines.

Définition du poste :

La personne titulaire du poste est placée sous l'autorité hiérarchique du coordinateur du pôle transversal « Collections » du PEPR Dynabiod. Elle est garante de la qualité, de la structuration, de l'interopérabilité et de la circulation des données des collections naturalistes produites et/ou mobilisées dans le cadre du programme. Elle contribue à leur transformation et à leur mise à disposition pour répondre aux besoins des communautés scientifiques, notamment aux travaux de modélisation.

Elle définit et met en oeuvre les procédures de contrôle et d'amélioration de la qualité des données, en s'appuyant sur les ontologies, référentiels et standards nationaux et internationaux applicables aux données de biodiversité. Elle développe et applique les traitements nécessaires à leur structuration, normalisation, enrichissement et harmonisation, afin d'en garantir la cohérence, la traçabilité, la pérennité et l'interopérabilité avec les bases et infrastructures existantes, notamment dans le cadre de l'IR Récolnat.

Elle participe au développement de méthodes, protocoles, chaînes de traitement et outils permettant d'assurer la qualité des données tout au long de leur cycle de vie. Elle met en place les flux nécessaires à leur intégration, leur partage et leur réutilisation, conformément aux principes FAIR et aux politiques de science ouverte, et veille à leur intégration dans les infrastructures et réseaux nationaux et internationaux de données sur la biodiversité.

Elle assure l'interface avec le pôle transversal 3 « Données » du PEPR Dynabiod et veille à la pleine mobilisation des données de collections dans les dispositifs et modèles développés par le programme. Elle contribue à leur articulation avec les autres typologies de données, en portant une attention particulière à leur compatibilité sémantique, leur qualité et leur interopérabilité.

Elle veille également à l'intégration des données d'images dans ces chaînes de qualité, de documentation, de conservation et de diffusion. Elle contribue à définir les modalités de leur partage et de leur ouverture, selon le principe « aussi ouvertes que possible, aussi fermées que nécessaire », et à leur valorisation dans les dispositifs de l'IR Récolnat.

En lien avec les services du Muséum national d'histoire naturelle, les établissements adhérents de Récolnat et les infrastructures françaises impliquées dans la gestion et la diffusion des données sur la biodiversité, elle contribue à l'harmonisation des pratiques, à l'interopérabilité des données et à leur valorisation dans une démarche de science ouverte. Elle participe à la définition et à la diffusion de recommandations, standards et bonnes pratiques auprès des équipes du programme.

En résumé, les missions et activités associées à ce poste relèvent largement des fonctions d'un·e data steward, appliquées aux données issues des collections naturalistes.

Elle peut, en outre, se voir confier des missions transversales au sein de la Direction générale déléguée aux Collections ou de l'établissement.

Activités :

I. Qualité et structuration des données

- Définir et mettre en oeuvre les procédures de contrôle qualité des données ;

- Participer à l'élaboration des protocoles d'informatisation avec le coordinateur du PT2, les responsables scientifiques et techniques des collections et les prestataires du programme ;

- Identifier, documenter et corriger les erreurs, incohérences et lacunes ;

- Utiliser les ontologies, référentiels et vocabulaires contrôlés pertinents ;

- Appliquer les traitements nécessaires à la normalisation, à l'enrichissement et à l'harmonisation des données tout en préservant les informations sources ;

- Adapter les données aux différents usages scientifiques en termes de format, résolution et granularité ;

- Rédiger et mettre à jour le dictionnaire de données tout au long du programme.

II. Interopérabilité et flux de données

- Concevoir et mettre en oeuvre les flux d'intégration, de transformation et de diffusion des données ;

- Garantir leur interopérabilité avec les bases et infrastructures existantes ;

- Veiller au respect des standards nationaux et internationaux ;

- Documenter les traitements et assurer la traçabilité des transformations ;

- Mettre en oeuvre et suivre la production de données à travers des indicateurs quantitatif et qualitatif ;

- Contribuer à l'architecture des chaînes de données du PEPR et à leur articulation avec l'IR Récolnat.

III. FAIR, science ouverte et données d'images

- Mettre en oeuvre les principes FAIR sur les données produites et mobilisées ;

- Organiser leur documentation, leur référencement, leur conservation et leur diffusion ;

- Assurer l'intégration des données d'images dans les chaînes de traitement et de diffusion ;

- Contribuer à définir les conditions d'ouverture et de réutilisation des données ;

- Contribuer à la rédaction du plan de gestion des données ;

- Veiller à l'intégration et à la valorisation des données dans l'infrastructure Récolnat.

IV. Interface scientifique et participation à l'animation de l'IR Récolnat

- Assister et apporter un appui au coordinateur du PT2 de Dynabiod pour l'ensemble des sujets relatifs aux données des collections produites dans le cadre du programme, notamment par la production et le suivi d'indicateurs sur leur qualité, leur volume, leur structuration et leur utilisation ;

- Assurer l'interface entre le pôle « Collections » et le pôle « Données » du PEPR Dynabiod ;

- Accompagner les équipes scientifiques et techniques dans la mobilisation des données de collections naturalistes ;

- Favoriser l'utilisation des données de collections dans les modèles et analyses des écologues ;

- Participer aux réseaux et groupes de travail nationaux autour des données de collections ;

- Conseiller et assister les équipes du MNHN et des établissements adhérents à Récolnat sur la qualité et l'interopérabilité des données de collections.

Profil recherché

Connaissances

- Connaissance des collections d'histoire naturelle et de leurs processus de gestion, de description et de numérisation ;

- Connaissance des principes de structuration, de qualité et d'interopérabilité des données scientifiques ;

- Connaissance des référentiels, standards et principes d'interopérabilité appliqués aux données naturalistes ;

- Connaissance des enjeux liés à la diffusion et à la réutilisation des données scientifiques, notamment dans le cadre des principes FAIR ;

- Connaissance du fonctionnement des réseaux professionnels et infrastructures de recherche et, idéalement, de l'environnement des collections naturalistes en France.

Compétences

- Structurer, contrôler, qualifier et documenter des données issues de sources hétérogènes ;

- Identifier et traiter les anomalies et incohérences dans les données ;

- Utiliser des outils de gestion et de traitement des données et assurer le suivi des flux entre différents systèmes ;

- Maîtriser et utiliser les technologies de l'information et de la communication ; la maîtrise d'outils informatiques bureautiques, de traitement et de raffinement de données serait très appréciée ;

- Très bonne connaissance des bases de données documentaires ;

- Formaliser des procédures et produire une documentation adaptée aux différents utilisateurs ;

- Travailler en réseau avec des interlocuteurs scientifiques, techniques et institutionnels.

Expérience et aptitudes

- Expérience en gestion, qualité ou structuration de données scientifiques, idéalement dans le domaine des collections naturalistes, de la biodiversité ou de la recherche ;

- Expérience du travail en réseau et de projets impliquant plusieurs partenaires ;

- Rigueur, méthode, sens de l'organisation et capacité d'analyse ;

- Autonomie, sens de l'initiative et capacité à résoudre des problèmes ;

- Qualités relationnelles et rédactionnelles, goût du travail collectif et capacité à s'adapter à de nouveaux outils et environnements techniques.

Information(s) complémentaire(s)

Venez rejoindre un établissement chargé d'histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d'une grande variété de métiers et d'activités, le Muséum vous propose d'intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.

Le contrat

Localisation : Jardin des plantes

Contrat : Contrat de projet

Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels

Les avantages

Remboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)

Restaurant d'entreprise

Mutuelle d'entreprise

Un comité social et une association sportive et culturelle

Accès illimité aux sites de l'établissement avec invités

• Gestion des données
• SGBD
• Sens du relationnel
• Autonomie
• Création d'une base documentaire
• Pro-activité
• Contrôle qualité
• Esprit d'analyse
• Normalisation
• Sens de l’organisation