Ingénieur·e de Recherche en Neurodéveloppement Organoïdes & Génomique H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Le projet vise à étudier la progression des lignages et les mécanismes guidant la diversification neuronale au cours du développement du système nerveux humain.Le projet s'appuiera sur des modèles d'organoïdes développés par notre laboratoire ainsi que sur des tissus embryonnaires, associés à des approches omiques globales et surtout à l'échelle de la cellule unique. L'objectif est d'explorer comment les voies de signalisation contrôlent les réseaux génétiques sous-jacents aux décisions de destin cellulaire et à l'évolution de la diversité neuronale dans le rhombencéphale et la moelle épinière humains. La personne recrutée sera en charge de réaliser des expériences sur divers modèles organoides et des tissus post mortem humains, réaliser des analyses bioinformatiques, de superviser des étudiants, techniciens et ingénieurs de l'équipe, présenter ses travaux dans la cadre de séminaires et écrire des articles scientifiques. L'Activité - Réalisation d'expérience de génomique (Chip-seq et ATAC-seq) en particulier de RNA-seq sur cellules uniques. Le projet requerra de tester de nouvelles méthodes de single cell RNA-seq en particulier sur tissus fixés- Transcriptomique spatiale- Réaliser des cultures de cellules souches pluripotentes humaines et leur différenciation en organoides, analyse des différenciation par méthode omics, de PCR ou d'histologie- analyse de tissus post-mortem embryonnaire par méthode omics, de PCR ou d'histologie- Imagerie confocale et analyse d'image subséquente. Quantification des données.- programmation/codage pour l'assemblage et analyse, incluant analyses statistiques, de jeux de ses propres données et de jeux de données existants à l'aide d'outils bioinformatiques.-Integration des resultats computationelles et experimentaux- Interprétation des résultats- Veille documentaire de publications pertinentes pour le domaine- Rédaction de rapports et de publications scientifiques (figures et écritures)- Présentation des travaux au sein de l'équipe et lors de réunions scientifiques- participation à la rédaction de demande de financement Votre Profil Compétences - Fort intérêt pour la biologie du développement et le neurobiologie- Une expertise préalable dans la réalisation et l'analyse de données de transcriptome de cellules uniques est absolument indispensables et doit absolument pouvoir être démontrée. - Une expérience en culture et différenciation de cellules ES murines ou ES/iPSC humaines sera un avantage très important. - Un excellent dossier scientifique avec publications sera privilégié.- Capacité à travailler de manière autonome et collaborative, avec un très bon esprit d'équipe- Bonnes compétences en communication, bonne maîtrise de l'anglais oral et écrit Votre Environnement de Travail - L'Institut Jacques Monod, situé au coeur de Paris, est un centre international de premier plan, doté d'une forte culture collaborative, offrant un environnement scientifique très interactif et un accès à des plateformes technologiques de pointe.- L' équipe Ribes/Nedelec propose un environnement de recherche stimulant à l'interface du neurodéveloppement, de la biologie cellulaire et de la génomique. Nous utilisons un large éventail de techniques - organoïdes, tissus embryonnaires, approches omiques, imagerie en temps réel - pour explorer les principes de la spécification du destin cellulaire et de la morphogenèse tissulaire. Nous avons récemment intégré de nouveaux locaux entièrement rénovés, incluant des salles de culture dédiées aux organoïdes humains. L'anglais est la langue de travail pour les réunions de laboratoire, les séminaires et la communication quotidienne. Contraintes et risques Travail en laboratoire L2. Astreintes le week-end et jours fériés possibles. Rémunération et avantages Rémunération 3230 € brut mensuel Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR7592-STENED-009 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) Expérience souhaitée 1 à 4 années À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

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