Thèse Défaut de Différenciation des Cellules Myéloïdes et Désorganisation du Paysage Immunitaire dans la Lmmc H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Paris-Saclay GS Life Sciences and Health École doctorale : Cancérologie : Biologie - Médecine - Santé Laboratoire de recherche : Cellules souches hématopoïétiques et développement des hémopathies myéloïdes Direction de la thèse : Christel GUILLOUF Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-01T23:59:59 Contexte : Dans les tumeurs myéloïdes chroniques, une mutation somatique survenant dans une cellule souche ou progéniteur hématopoïétique (CSPH) peut conduire à l'émergence d'un clone leucémique. Pourtant, les CSPH conservent une capacité de différenciation, générant des cellules myéloïdes matures clonales, dysplasiques et pro-inflammatoires. Des données expérimentales montrent que ces cellules contribuent à la progression de la maladie par 2 mécanismes : leurs propriétés immunosuppressives et la sécrétion de cytokines qui favorisent un microenvironnement compétitif pour les CSH mutées, au détriment des cellules sauvages résiduelles.
Le modèle d'étude sera la leucémie myélomonocytaire chronique (LMMC), qui allie des caractéristiques dysplasiques et prolifératives. Elle résulte des mutations de CSPH (TET2, ASXL1, SRSF2..). La greffe allogénique de CSH constitue le seul traitement curatif, mais reste peu applicable en raison de l'âge avancé des patients (72 ans en moyenne au diagnostic). Les agents hypométhylants n'éliminent pas le clone muté ni ne préviennent la transformation en leucémie aiguë. L'analyse clonale révéle la disparition des CSH sauvages. Il est nécessaire de développer des stratégies thérapeutiques alternatives pour contrôler l'évolution de cette maladie au pronostic défavorable (survie médiane de 2 à 3 ans).
Hypothèse : Dans la LMMC, les cellules matures du clone leucémique sont quantitativement et/ou fonctionnellement perturbées dans la LMMC, ce qui pourrait en retour affecter l'environnement et favoriser l'expansion de CSPH mutées dont la différenciation est biaisée.
Nos travaux : L'équipe a démontré que la LMMC est caractérisée par une accumulation de monocytes classiques (cMO) au détriment des monocytes non classiques (ncMO), dont la quantification constitue désormais un critère diagnostique (cMO 94%, classification OMS 2022). Ce déséquilibre résulte d'un mécanisme épigénétique : la méthylation aberrante du promoteur de MIR150 entraîne une diminution de l'expression de ce microARN, bloquant la conversion des cMO en ncMO. Les cellules dendritiques plasmacytoïdes (présentes en excès dans la moelle de 20 % des patients), crée un contexte immunosuppresseur avec accumulation de cellules T régulatrices. Des polynucléaires neutrophiles immatures s'accumulent dans le sang. La présence de ces cellules immunossuppressives (MDSC) est de mauvais pronostic. Ces cellules sécrètent de l'IL-8, qui altère la croissance des CSPH sauvages tandis que les CSPH mutées y sont insensibles en raison d'une régulation épigénétique des récepteurs, conférant ainsi un avantage compétitif au clone leucémique.
Projet: Par des approches à l'échelle unicellulaire, le projet vise à intégrer les DC à la cartographie du microenvironnement leucémique afin de comprendre leur contribution à la progression de la maladie (dérégulation de la réponse immunitaire adaptative et du microenvironnement). Les premiers résultats montrent une répartition anormale des sous-populations de DC dans le sang et la moelle, associée à une perte fonctionnelle et à un défaut de différenciation des DC1 et DC2 au profit des DC3 inflammatoires. Ce travail de thèse analysera les mécanismes génétiques et épigénétiques à l'origine de ces anomalies et s'articulera autour de 3 objectifs : i) identifier les altérations épigénétiques des progéniteurs associées au défaut de différenciation DC dans la LMMC ; ii) tester le rôle fonctionnel de ces altérations dans des systèmes de différenciation organoïdes ; iii) évaluer des stratégies de ciblage thérapeutique visant à restaurer la différenciation DC.

Ces travaux devraient permettre d'identifier des stratégies thérapeutiques innovantes visant à contrôler la différenciation des cellules myéloïdes dans la LMMC, afin de limiter la progression de la maladie sans nécessairement éradiquer le clone leucémique. Les résultats obtenus pourraient être transposables à d'autres hémopathies myéloïdes chroniques.
Chronic myelomonocytic leukemia (CMML) is a relatively rare but severe clonal myeloid hemopathy associated with the accumulation of somatic variants in a hematopoietic stem cell (HSC). The molecular signatures of the disease are signatures of ageing. This disease, which induces a peripheral blood monocytosis, associates features of myelodysplastic syndromes and myeloproliferative neoplasms. This leukemia is poorly explored, its diagnosis is difficult and the factors associated with the prognosis poorly known. Allogeneic HSC transplantation is the unique potentially curative therapeutic approach. As age and comorbidities frequently preclude this treatment, there is an urgent need for alternative solutions. CMML is often associated to inflammatory environment and immune defect. It presents a high heterogeneity of myeloid cells involved in (1) amplifying immunosenescence in often elderly patients by generating immunosuppressive cells, and (2) creating a deleterious microenvironment through the cytokines they secrete. The overall goal of this project is to characterize mature myeloid cells of the clone and normal or leukemic stem cells to propose innovative therapeutic approaches in chronic myeloid malignancies. Dendritic cells are part of the circulating mature cells of the leukemic clone in these diseases. Their quantity and their differentiation are dysregulated. By combining different single cell approaches and 3D cultures, the aim of the thesis is to better characterize the heterogeneity of the dendritic cells, their functional properties and the mechanisms that disrupt their generation in certain leukemias. This study will provide insights into the epigenetic mechanisms driving defective myeloid cell differentiation in LMMC and may reveal new therapeutic targets capable of restoring normal DC development and limiting disease progression. Single cell analysis with scRNAseq, scATACseq and spectral flow cytometry, CUT&Tag, Conventionnal flow cytometry, Cell labelling and sorting, Purification of blood and marrow mononucleated cells, Cell culture, progenitor culture, Hematopoietic differentiation tests in 3D system, functional tests

Etudiant titulaire d'un master 2 recherche ou équivalent (école d'ingénieur)
Avec un intérêt - et lorsque possible une expérience - en biologie cellulaire et moléculaire - en particulier mais pas exclusivement s'il existe une expérience en hématologie