Thèse Dynamique Collective et Chimiotaxie Bactérienne H/F - Doctorat_Gouv

Établissement : Université Paris-Saclay GS Sciences de l'ingénierie et des systèmes
École doctorale : Sciences Mécaniques et Energétiques, Matériaux et Géosciences
Laboratoire de recherche : Fluides, Automatique et Systèmes Thermiques
Direction de la thèse : Harold AURADOU ORCID 0000000329396566
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-21T23:59:59

L'objectif de cette thèse est d'utiliser la microfluidique pour modéliser la colonisation de l'environnement par des bactéries, en se concentrant particulièrement sur la manière dont des bactéries comme Caballeronia insecticola colonisent l'intestin. Bien que le rôle des signaux chimiques dans ce processus ait été largement étudié, l'influence du confinement géométrique et des mouvements collectifs sur la sélection des espèces reste encore mal comprise. Dans le cadre de cette thèse, nous proposons d'utiliser la microfluidique pour reproduire les structures géométriques présentes dans les environnements naturels, afin d'en déterminer l'impact sur la sélection des espèces.

For several years, our two teams have been developing experiments that combine microfluidics and microbiology. This collaboration has been facilitated by the proximity of our two units, both located at Université Paris-Saclay. It has led to the co-supervision of two PhD students and several interns, as well as multiple co-authored publications in international journals.

Developing microfluidic tools to model natural bacterial colonization phenomena

Le candidat ou la candidate devra posséder une solide formation en microbiologie ou en mécanique des fluides. Un vif intérêt pour la conception et la réalisation d'expériences, ainsi que pour le traitement et l'analyse d'images, sera particulièrement apprécié.