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Data Steward - Standardisation des Données Cliniques Omop-Cdm H/F - 75

Description du poste

L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.

Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.

Missions :

Votre mission : donner du sens aux données pour accélérer la découverte
L'institut Pasteur recherche un(e) Data Steward pour accompagner sa transformation vers la standardisation de ses données de santé.

Au sein de la Plateforme de Data Management, (9 data managers, 2 data stewards) vous serez le(la) référent(e) de la transformation, de la qualité et de l'interopérabilité de nos données cliniques en les standardisant au format OMOP-CDM (Common Data Model de l'Observational Health Data Sciences and Informatics - OHDSI). Vous accompagnerez nos équipes de recherche à l'utilisation de ce format et pourrez être impliqué(e) plus largement dans la gestion des données de recherche biomédicale, cliniques et pré-cliniques.

En particulier, vous superviserez la gestion des données cliniques de deux projets d'envergure :
- EVH (European Vaccine Hub) : consortium européen créant des synergies entre les meilleures expertises en vaccinologie européennes via la mise en place d'un continuum allant de la recherche la plus fondamentale jusqu'aux essais cliniques, en partenariat avec les entreprises productrices de vaccins.
- Un consortium français visant à développer notre compréhension des mécanismes et trajectoires de maladies chroniques
Nous recherchons un(e) candidat(e) qui aime structurer, organiser des projets complexes et faciliter la gestion des données entre équipes internationales.

Ce que vous ferez concrètement
- Définir les règles de gestion et de qualité des données pour les deux consortiums en vous assurant que chaque partenaire les connaisse et soit en capacité de les appliquer.
- Collaborer étroitement avec les investigateurs cliniques, les biostatisticiens et les responsables IT pour comprendre les spécificités des données EVH et celles du deuxième consortium (p. ex. données Omiques) et sensibiliser à la bonne gestion des données
- Concevoir et implémenter des workflows pour convertir les données des 2 projets vers le modèle OMOP-CDM et plus largement accompagner la plateforme de Data Management de l'Institut pasteur à standardiser vers ce format
- Former les membres des consortiums et les chercheurs de l'Institut Pasteur au format OMOP-CDM
- Assurer la qualité des données transformées et valider les droits d'accès et de partage en fonction des besoins des projets et de la réglementation
- Mapper les données sources vers les vocabulaires standardisés internationaux (SNOMED CT, LOINC, RxNorm, ICD-10)
- Documenter les processus
- Contribuer au partage de données des 2 projets dont vous aurez la charge
- Participer au développement de la communauté OMOP-CDM (conférences, workshops)

Compétences requises

  • Python
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Chiffres clés de l'emploi à Paris

  • Taux de chomage : 9%
  • Population : 2165423
  • Médiane niveau de vie : 28570€/an
  • Demandeurs d'emploi : 205650
  • Actifs : 1177663
  • Nombres d'entreprises : 490838

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