Ingénieur·e en Bioinformatique et Immuno-Oncologie H/F - 75

Le Centre de Recherche des Cordeliers (CRC) a une renommée internationale, il compte 550 personnes, 16 équipes de recherche, 4 plateformes technologiques. Le CRC a pour tutelles principales l'Inserm, Sorbonne Université et l'Université Paris Cité. Les projets de recherche portent principalement sur l'étude des mécanismes impliqués en cancérologie, immunologie, métabolisme et physiopathologie. Le CRC est localisé au centre de Paris, dans le campus des Cordeliers, rue de l'école de médecine. Les thématiques scientifiques développées au CRC sont principalement dans le domaine de la cancérologie, l'immunologie, le métabolisme et la physiopathologie. Plusieurs équipes développent des recherches en bio-informatique, bio-statistique et intelligence artificielle.- Mission principale:

Dans le cadre des activités de recherche de l'équipe «Inflammation, Complément et Cancer» (INSERM UMRS1138, Centre de Recherche des Cordeliers), le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (cytométrie en flux multiparamétrique, protéomique sérique ou tissulaire) avec des données cliniques issues de cohortes de patients. L'objectif est d'identifier de nouveaux biomarqueurs associés à des phénotypes cliniques (réponse thérapeutique, toxicité, progression) et de mieux comprendre les mécanismes biologiques sous-jacents.

- Activités principales:

· Analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues de cytométrie en flux et de plateformes protéomiques

· Intégration multi-omique : mise en oeuvre d'approches d'intégration de données hétérogènes (biologiques et cliniques).

· Analyse statistique et modélisation : analyses exploratoires, analyses multivariées, clustering, réduction de dimension, identification de signatures biologiques et découverte de biomarqueurs.

· Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python

· Interaction avec l'équipe : échanges réguliers avec biologistes, cliniciens et biostatisticiens ; participation aux réunions de projet.

· Rédaction et communication scientifique : préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.

· Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques (FAIR, traçabilité).