Ingénieur d'Études en Bioinformatique H/F - 75

Mission principale :

La personne recrutée aura pour mission l'analyse et l'intégration bioinformatiques de données omiques (bulk RNAseq, single nuclei RNAseq, spatial transcriptomic, methylome) obtenus à partir d'échantillons tumoraux et de modèles tumoraux humains et murins. Elle travaillera en interaction avec l'investigateur principal, les bioinformaticiens senior et junior, les postdoctorantes, les ingénieures en biologie et les étudiant(e)s pour contribuer par son expertise bioinformatique aux projets de recherche de l'équipe.

Activités principales :

· Contrôle qualité, quantification de l'expression en bulk, cellule unique et transcriptomique spatiale, analyse de la variance, regroupement hiérarchique, analyse différentielle, annotation fonctionnelle, analyse récepteur-ligand

· Conception de signatures d'expression à partir de données en cellules uniques et appariemment avec les données transcriptomiques spatiales sans ou avec déconvolution

· Contrôle qualité et quantification de la méthylation; conception de signatures de régions différentiellement méthylées, corrélation avec l'expression et analyse de l'hétérogénéité intratumorale et intertumorale