Ingénieur d'Études en Plateforme Bio-Informatique Support à l'Analyse de Données Omiques H/F - 75

Résumé du poste
- Conseiller, lors de la construction d'un projet, sur les méthodes et outils pertinents lors de l'élaboration d'un pipeline complet de séquençage et analyse de résultats.
- Accompagner le traitement et l'exploitation des données, mise en place ou adaptation de pipelines pour leur analyse et interprétation, tout en assurant le débo-gage des scripts en cas d'arrêt d'exécution sur le cluster.
- Contribuer à la valorisation des résultats à travers des outils visuels, des rapports analy-tiques ou des publications.
- Accompagner la gestion du cycle de vie des données du calcul, leur organisation, leur suivi et leur exploitation jusqu'à la visualisation
- Assurer le transfert de connaissances et des savoir-faire par la participation aux réunions bio-informatiques, la conduite de formations et l'accompagnement de scientifiques
Ce poste implique un rôle clé dans l'accompagnement des équipes pour les rendre autonomes tout en répondant aux besoins techniques et scientifiques des projets.

DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS

1) Accompagnement et conseil scientifique
- Soutenir les équipes de biologie du site des Grands Moulins (BFA, EDC, IJM) dans la définition des analyses nécessaires pour répondre à leurs questions biologiques, depuis la conception des projets jusqu'à la valorisation des résultats.
- Fournir des recommandations sur les techniques de séquençage (type, profondeur, para-mètres) et les stratégies analytiques adaptées, en favorisant une approche collaborative et l'autonomie des équipes.
- Aider les utilisateurs à comprendre et exploiter efficacement les outils bioinformatiques disponibles pour leurs analyses.
2) Support technique collaboratif
- Accompagner les utilisateurs dans la résolution des difficultés techniques en bioinforma-tique, tout en leur apportant les outils nécessaires pour gagner en autonomie.
- Accompagner les utilisateurs dans l'utilisation du cluster et les assister pour résoudre les problèmes rencontrés.
- Prendre en charge, si nécessaire, des étapes spécifiques d'analyses complexes, tout en trans-férant les compétences pour pérenniser l'expertise au sein des équipes.
3) Formation et transfert de compétences
- Former les membres des équipes à l'utilisation des outils bioinformatiques et à l'interprétation des résultats, en favorisant leur montée en compétences.
- En coordination avec les autres intervenants d'iPOP-UP, proposer des sessions de formation ou des ateliers pour renforcer l'autonomie des équipes sur des outils ou méthodes spéci-fiques.
- Participer à la formation et aux conseils à l'utilisation du cluster et sa documentation.
4) Conception et diffusion méthodologique
- Mettre en place et adapter des pipelines bioinformatiques en collaboration avec les cher-cheurs, en s'assurant de leur appropriation par les équipes.